obróbka pliku typu txt

Robię analizę możliwości hybrydyzacji microRNA do 3'UTRów ludzkich genów. Standardowo wykorzystuję do tego program MiRanda. W bazie danych jest ponad 31000 sekwencji 3'UTR.

Jeśli zadam programowi skonfrontowanie sekwencji jednego microRNA z 31000 sekwencji dostaje plik txt w którym są zarówno znalezione hybrydyzacje jak i informacje dla których genów nie znaleziono hybrydyzacji. I teraz pojawia się problem natury praktycznej. Ze względu na to że genów jest tak wiele a pozytywnych wyników dostaję zaledwie koło 100-200 muszę je jakoś wydobyć z tego wielkiego pliku który dostaję. Próbowałem ręcznie kopiować tylko te wyniki pozytywne do innego pliku ale po 4 godzinach przeskanowałem zaledwie 5% całego pliku więc nie jest to dobre rozwiązanie.

Może ktoś z was zna jakiś program lub skrypt (pod windowsa lub linuxa) który mógłby mi pomóc w selekcji wyników ponieważ sam program MiRanda niewiedzieć czemu nie ma takiej opcji

będę wdzięczny za pomoc