Triada katalityczna

Mam wielką prośbe!!! Czy ktos mógłby wyjaśnić mi o co chodzi z triadą katalityczną np papainy?? jak ona działa...bo ja coś połapać się nie mogę

katalityczna triada to, nazywając inaczej, trzy reszty aminokwasowe które bezpośrednio lub pośrednio biorą udział w reakcji chemicznej z substratem - sa to niezbedne reszty aminokwasowe dla zajscia reakcji. znajduja sie w centrum katalitycznym enzymu.

W przypadku chymotrypsyny sa to reszty Asp, His i Ser - tworza katalityczna triade. His i Ser bezposrednio reaguja z wiazaniem peptydowaym a reszta Asp stabilizuje dodatnio naladowana forme histydynę z triady. wszystkie trzy sa niezbedne do przeprowadzenia reakcji. pozostale aminokwasy w bialku nie uczestnicza w reakcji - mozesz sobie wyobrazic ze tworza "rusztowanie" na ktorym w bardzo specyficznych miejscach (!) umocowane sa reszty aminokwasowe triady katalitycznej.

czy to ci cos wyjasnilo, czy tylko lalem wode

tak, mam nadzieję, że jak doczytam resztę, bardzij szczegółowe rzeczy to będzie ok dzięki bardzo

papaina jest proteinaza cysteinowa - zamiast Ser jest Cys, poza tym mechanizm generalnie taki sam, jak w przypadku chymotrypsyny.

tutaj niestety nie moge sie zgodzic, bo jeszcze kilka aminokwasow (konkretnie ich grupy aminowe) bierze udzial w reakcji tworzac 'dziure oksyanionu' stabilizujaca tetraedryczny stan przejsciowy...
po dokladny mechanizm odsylam do Stryera albo googla, albo tu: http://www.actabp.pl/pdf/4_2004/861.pdf.

i poprawka do samego siebie: papaina ma Cys zamiast Ser i Asn zamiast Asp

dzieki Michal za poprawke ! takie fajne porownanie mi sie zdalo a jednak mialo dziure wielkosci oksyanionu