« Biotechnologia

BLAST

BLAST - Grupa programów służąca do porównywania sekwencji białkowych i genomowych, wyszukiwania podobieństw między nimi.

BLAST ( ang. Basic Local Alignment Search Tool) to grupa programów, które towarzyszą białkowym i genomowym bazom danych. Ich zadaniem jest porównywanie sekwencji genomowych i białkowych oraz wyszukiwanie podobieństw między nimi.
Programy z tej grupy jako informację wejściową wykorzystują dane zgromadzone przez użytkownika i następnie przeszukują bazę NCBI ( www.ncbi.nih.gov )

Istnieje kilka odmian programu BLAST. Różnica polega na typie analizowanych sekwencji oraz wykorzystywanymi bazami danych.

Najpopularniejsze programy z grupy BLAST to:
- TBLASTX - służy do porównywania sekwencji białkowych z bazą danych sekwencji nukleotydowych (stosowana w szczególnych sytuacjach)
- TBLASTN - służy do porównywania sekwencji białkowych z bazą danych sekwencji nukleotydowych
- BLASTX- służy do porównywania sekwencji z bazą danych sekwencji białkowych
- BLASTN - służy do porównywania sekwencji z bazą danych sekwencji nukleotydowych

Narzędzia BLAST są szczególnie wykorzystywane jako początkowy etap analizy teoretycznej w dziedzinie bioinformatyki.

Dodane przez: Kasia M

WydrukujWydrukuj
Inne słówka na literę:

  • Bakteriocyny

    grupa substancji zdolnych do antagonistycznego oddziaływania zwykle na bliskospokrewnione grupy drobnoustrojów z wytwarzającymi je organizmami. » więcej

  • Białka integralne

    to białka połączone silnymi oddziaływaniami hydrofobowymi z węglowodorowymi łańcuchami lipidów błon i można je oddzielić dopiero w obecności czynników, które mogą konkurować z tymi niepolarnymi oddziaływaniami, a więc poprzez użycie detergentów. » więcej

  • Białka peryferyjne

    białka związane z powierzchnią błony głównie przez interakcje elektrostatyczne i wiązania wodorowe. » więcej

  • Biblioteka DNA

    Jest to zbiór zrekombinowanych klonów zawierający wszystkie sekwencje występujące w danym DNA z częstością proporcjonalną do częstości ich występowania w materiale wyjściowym. » więcej

  • Biodeterioracja

    Proces mikrobiologicznego rozkładu surowców i materiałów ekonomicznie ważnych dla człowieka. » więcej